三沙市所辖的西沙群岛、中沙群岛、南沙群岛的岛礁及其海域，拥有大量的文物遗址，是我国水下考古的“富矿区”，至纯天珠，三沙市的设立，将给水下考古工作带来很大的便利，文玩，推动南海水下考古工作迈上新的台阶。
海南省博物馆正在展出的“华光礁1号”沉船特展，每天都迎来大批的参观者，展出的古瓷器等出土文物展现了南宋时期我国在南海海域进行海外贸易的辉煌历史。据了解，截至目前我国已在南海海域发现了近千艘沉船，其中大部份为我国的贸易船只，同时在南海的岛礁上也发现了我国的文物古迹。
近年来，为了发掘南海的水下沉船等中国文物，海南快速推进南海水下考古工作，特别是从2007年西沙考古工作队历时两年半对“华光礁1号”古沉船遗址进行考古发掘，由于当时的补给全部需要从海南本岛运送，所需时间较长给水下考古带来很大不便。而现在，这些困局将随着三沙市的设立得到改变。
海南省博物馆馆长邱刚说，文玩，三沙市成立后，海南在南海海域系统性水下考古工作将全面展开。不久，新的南海水下考古发现将呈现在世人面前。